Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms