Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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