Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Skap2Q3UND0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms