Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Snx27Q3UHD6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx27Q3UHD6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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