Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nom1Q3UFM5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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