Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cops9Q3U898 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms