Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk3Q3U3Q1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ulk3Q3U3Q1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms