Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gse1Q3U3C9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms