Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srsf6Q3TWW8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf6Q3TWW8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms