Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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