Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm21440Q3TTD8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm21440Q3TTD8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm21440Q3TTD8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm21440Q3TTD8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm21440Q3TTD8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm21440Q3TTD8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm21440Q3TTD8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21440Q3TTD8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm21440Q3TTD8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21440Q3TTD8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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