Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdnep1Q3TP92 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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