Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ap5b1Q3TAP4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ap5b1Q3TAP4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms