Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hddc2Q3SXD3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hddc2Q3SXD3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hddc2Q3SXD3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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