Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccbe1Q3MI99 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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