Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms