Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39dQ0VF76 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms