Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps8Q0P5W1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms