Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms