Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MitfQ08874 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms