Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NrepQ07475 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NrepQ07475 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
NrepQ07475 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms