Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cab39Q06138 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cab39Q06138 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cab39Q06138 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cab39Q06138 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Cab39Q06138 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Cab39Q06138 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Cab39Q06138 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cab39Q06138 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cab39Q06138 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cab39Q06138 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms