Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox9Q04887 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox9Q04887 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox9Q04887 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox9Q04887 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox9Q04887 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox9Q04887 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sox9Q04887 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox9Q04887 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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