Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cxcr5Q04683 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cxcr5Q04683 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cxcr5Q04683 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cxcr5Q04683 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cxcr5Q04683 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Cxcr5Q04683 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr5Q04683 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr5Q04683 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr5Q04683 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr5Q04683 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr5Q04683 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr5Q04683 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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