Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms