Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff2Q03404 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms