Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Msx2Q03358 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms