Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms