Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb5Q02739 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms