Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms