Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp1Q01514 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms