Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Col1a2Q01149 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col1a2Q01149 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms