Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb2Q00977 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms