Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms