Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
F8a1Q00558 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
F8a1Q00558 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms