Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SmsP97355 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SmsP97355 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SmsP97355 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SmsP97355 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SmsP97355 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SmsP97355 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SmsP97355 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmsP97355 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmsP97355 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmsP97355 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmsP97355 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmsP97355 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmsP97355 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmsP97355 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmsP97355 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SmsP97355 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmsP97355 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SmsP97355 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SmsP97355 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SmsP97355 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmsP97355 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SmsP97355 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmsP97355 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmsP97355 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmsP97355 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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