Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms