Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx1P83917 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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