Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ptprn2P80560 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprn2P80560 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ptprn2P80560 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ptprn2P80560 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ptprn2P80560 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ptprn2P80560 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ptprn2P80560 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ptprn2P80560 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ptprn2P80560 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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