Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Msx3P70354 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Msx3P70354 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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