Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pkn1P70268 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pkn1P70268 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pkn1P70268 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pkn1P70268 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pkn1P70268 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pkn1P70268 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkn1P70268 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pkn1P70268 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms