Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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