Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P58686 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P58686 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P58686 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms