Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ctdsp1P58466 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ctdsp1P58466 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ctdsp1P58466 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ctdsp1P58466 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ctdsp1P58466 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ctdsp1P58466 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms