Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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