Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms