Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Aqp4P55088 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Aqp4P55088 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms