Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms