Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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PtpreP49446 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PtpreP49446 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PtpreP49446 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PtpreP49446 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PtpreP49446 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PtpreP49446 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PtpreP49446 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtpreP49446 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PtpreP49446 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PtpreP49446 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtpreP49446 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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