Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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